动物所是以动物科学基础研究为主的社会公益型国家级科研机构。主要定位在围绕农业、生态、环境和人类健康及其人与自然协调并存等方面的国家重大需求和重要科学问题，结合动物科学最新发展方向，通过加强传统优势学科和新型学科和技术的交叉融合，以野生动物和模式动物为研究对象，在细胞编程与重编程的机制、干细胞生物学、生殖与发育调控、生物灾害爆发机制与控制、物种濒危机制与保护和物种形成与多样性维持机制等领域开展基础性、前瞻性和战略性研究，推动重大成果的转移转化，服务于国家“生态高值农业和生物产业”、“普惠健康保障”和“生态与环境保育发展”战略需求。在我国生殖与发育、动物分类与进化、农业虫鼠害防控和珍稀濒危动物保护等领域中发挥不可替代作用。