移动版 | 网站地图 | 联系我们 | 所长信箱 | English | 中国科学院
 
首 页 机构概况 机构设置 研究成果 研究队伍 博士后 研究生教育 所级中心 合作交流 科学传播 创新文化 党群园地 信息公开
机构设置
科研部门
管理部门
支撑部门
挂靠部门
现在位置:首页 > 机构设置 > 科研部门
计算与进化生物学研究中心

  计算与进化生物学研究中心 2007年8月23日在北京成立。该中心的成立旨在加强北京地区生物学、数学、统计学和计算学科研人员的合作与交流。该中心起始阶段为跨单位、跨学科的开放性非实体机构,设立在中国科学院动物研究所。目前研究中心邀请了中科院动物研究所、中科院植物研究所、中科院北京基因组研究所、中科院遗传与发育生物学研究所、中科院微生物研究所、中科院数学与系统科学研究院应用数学研究所等机构的14名中国科学家作为中心成员;同时还邀请了英国伦敦大学学院、美国加州大学、美国北卡罗莱那州立大学、美国亚利桑那州立大学、美国杜克大学、瑞士伯尔尼大学、丹麦哥本哈根大学、欧洲生物信息研究所等机构的10位国外专家作为客座教授参与研究中心的合作与交流。

Publications from the Center:

  • Ziheng Yang and Bruce Rannala (2012) Molecular phylogenetics: principles and practice.  NATURE REVIEWS GENETICS, VOLUME 13: 303-314.
  • Zhang C, Rannala B, Yang Z (2012) Robustness of Compound Dirichlet Priors for Bayesian Inference of Branch Lengths. Systematic Biology (advance published online, 2012). doi: 10.1093/sysbio/sys030
  • Cressman R , Song JW , Zhang BY , Tao Y (2012) Cooperation and evolutionary dynamics in the public goods game with institutional incentives . JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY 299: 144-151.
  • Xia LX , Zheng XD , Zheng WJ, Zhang GQ , Wang HL , Tao Y , Chen DH (2012)The Niche-Dependent Feedback Loop Generates a BMP Activity Gradient to Determine the Germline Stem Cell Fate. CURRENT BIOLOGY 22: 515-521.
  • Rannala B, Zhu T, Yang Z (2012) Tail Paradox, Partial Identifiability, and Influential Priors in Bayesian Branch Length Inference. MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 29: 325-335.
  • Chen J, Wu YC, Chen X, Ji YJ, Zhang DX (2011) A simple and reliable method for discriminating between Helicoverpa armigera and Helicoverpa assulta (Lepidoptera: Noctuidae). INSECT SCIENCE 18: 629-634.
  • Zhang C, Zhang D-X, Zhu T, Yang Z (2011) Evaluation of a Bayesian coalescent method of species delimitation. Syst Biol 60:747-761.
  • Groussin M, Pawlowski J, Yang Z (2011) Bayesian relaxed clock estimation of divergence times in Foraminifera. Mol Phylogenet Evol 61:157-166.
  • Zang LL, Zou XH, Zhang FM (2011) Phylogeny and species delimitation of the C-genome diploid species in Oryza. JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION 49: 386-395
  • dos Reis M, Yang Z (2011) Approximate likelihood calculation for Bayesian estimation of divergence times. Mol Biol Evol 28:2161¬-2172.
  • Leng L, Zhang DX (2011) Measuring population differentiation using G(ST) or D? A simulation study with microsatellite DNA markers under a finite island model. Mol Ecol 20:2494-2509.
  • Zheng XD, Yang XQ, Tao Y (2011) Bistability, Probability Transition Rate and First-Passage Time in an Autoactivating Positive-Feedback Loop. PLOS ONE 6: e17104
  • Yang Z, dos Reis M (2011) Statistical properties of the branch-site test of positive selection. Mol Biol Evol 28:1217-1228.
  • Zheng XD; Tao Y (2011) Stochastic Analysis of Gene Expression. YEAST GENETIC NETWORKS: METHODS AND PROTOCOLS 734: 123-151.
  • Huang ZS, Zhang DX (2010) CVhaplot: a consensus tool for statistical haplotyping. Mol Ecol Resour 10:1066–1070.
  • Yang Z, Rannala B (2010) Bayesian species delimitation using multilocus sequence data. Proc Natl Acad Sci USA 107:9264-9269.
  • Zheng XD, Tao Y (2010) Effects of bidirectional regulation on noises in gene networks. PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS 12: 2418-2426
  • Zhang DX, Yan LN, Ji YJ, Hewitt GM, Huang ZS (2009) Unexpected relationships of substructured populations in Chinese Locusta migratoria. BMC Evol Biol 9:144. doi:10.1186/1471-2148-9-144.
  • Huang ZS, Ji YJ, Zhang DX (2009) Internal algorithm variability and among-algorithm discordance in statistical haplotype reconstruction. Mol Ecol 18:1556-1559.
  • Ji T, Zhang BY, Sun YH, Tao Y (2009) Evolutionary dynamics of fearfulness and boldness. JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY 256: 637-643.
  • Zheng XD, Tao Y (2008) Additivity of noise propagation in a protein cascade. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 128: 165104.
  • Huang ZS, Ji YJ, Zhang DX (2008) Haplotype reconstruction for scnp DNA: a consensus vote approach with extensive sequence data from populations of the migratory locust (Locusta migratoria). Mol Ecol 17:1930-1947.

  Copyright © 1995-2017 中国科学院动物研究所 版权所有
备案序号:京ICP备05064604号 文保网安备案号:1101050062
地址:北京市朝阳区北辰西路1号院5号 邮编:100101
电子邮件: ioz@ioz.ac.cn, 电话: 10-64807098, 传真: 10-64807099